Как выбрать днк амплификатор Real-time DT-Prime для лаборатории
96 лунок по 0,2 мл или 384 позиции по 0,045 мл - от этого зависит, войдут ли сравниваемые образцы в один прогон. Для днк амплификатора уровня Real-time DT-Prime это первый вопрос ТЗ, если лаборатория выросла из компактной платформы на 48 позиций.
В рекомендациях MIQE для сравнения экспрессии между образцами предпочтительнее ставить as many samples as possible in the same run S1. Если прогон всё же делят, identical samples that are tested in both runs ("inter-run calibrators" or IRCs) must be analysed S1. Ниже - как карточка DT-Prime закрывает поток, мультиплекс и клинический контур, без повторения обзора DT-Lite для малого потока.
Поток образцов: моноблок M1, секции M3/M6 и формат X1
Днк амплификатор для среднего и большого потока выбирают по тому, сколько образцов и контролей встанет в одну постановку.
| Блок | Формат | Когда уместен |
|---|---|---|
| M1 | 96 лунок × 0,2 мл | Стандартные планшеты, клинические серии, пробирки 0,2 мл |
| M3 | 3 × 32 лунки | Параллельные программы на одном приборе |
| M6 | 6 × 16 лунок | Шесть независимых зон термостатирования |
| X1 | 384 лунки × 0,045 мл | Высокая плотность, скрининг, большие когорты |
Секционные M3 и M6 дают независимое зональное термостатирование: удобно, когда в одной смене идут разные протоколы, но один корпус. X1 снижает риск дробить когорту на несколько прогонов, если методика допускает объём 0,045 мл.
Каналы детекции и мультиплекс
Для нескольких мишеней в одной пробирке смотрят число каналов и спектр. У DT-Prime на блоке M1 - 4 или 5 каналов на выбор; у M3, M6 и X1 - 5 каналов. Спектр четырёх каналов: 470-675 нм; у пяти - 470-750 нм. Источник возбуждения - LED, детектор - CCD-массив.
При мультиплексе авторы MIQE требуют показать, что accurate quantification of multiple targets in a single tube is not impaired S1. В ТЗ закладывайте пилот с вашими наборами и красителями, а не только паспорт прибора.
В каждом эксперименте нужны no template controls (NTC) - essential for detecting PCR contamination and must be performed with every experiment S1. Резервируйте лунки под NTC в сетке 96/384, особенно при роботизированной подаче.
Температура, градиент и динамика цикла
По карточке Real-time DT-Prime:
- Диапазон 0-100 °C, дискретность 0,1 °C, точность ±0,2 °C.
- Нагрев/охлаждение для серии M: 3,3 / 2,1 °C/с; для X1: 2,1 / 1,0 °C/с.
- Температура крышки 105 °C, автоподстройка по высоте пробирок.
- Температурный градиент в термоблоке для оптимизации программ.
Элементы Пельтье и заявленный ресурс LED (до 100 000 ч эффективной работы в описании) важны при длинных сменах и серийной диагностике: меньше простоя на замену оптики, если график плотный.
ПО DT-Master, ЛИС и клинический контур
Амплификатор днк технологии DT-Prime позиционируется как открытая платформа: совместимость с широким спектром наборов и расходников, сопряжение с лабораторными информационными системами, автономная работа без постоянного управления с ПК.
Русскоязычное ПО DT-Master по описанию включает количественную оценку ДНК/кДНК, анализ кривых плавления, экспрессию генов, SNP, биоценозы; есть функции клинических протоколов с автоматической трактовкой. На карточке указано регистрационное удостоверение для клинически значимых результатов ПЦР - для диагностических лабораторий это отдельный фильтр закупки.
Отчётность по MIQE напоминает: публикация и аудит требуют MIQE guidelines: minimum information for publication of quantitative real-time PCR experiments S1. Даже без статей в журналах лаборатории выигрывают, если в ЛИС уходят поля протокола, а не только итоговый Cq.
Габариты 21 × 54 × 54 см, масса 27 кг - планируйте стол и доступ сервиса; для роботизированной пробоподготовки в описании заявлена совместимость.
Как выбрать днк амплификатор Real-time DT-Prime для ваших задач?
Осознанный выбор снижает риск купить избыточный блок или, наоборот, упереться в лимит лунок через полгода.
- Плотность лунок: если сравниваете десятки образцов ежедневно, считайте M1 96 или X1 384; для шести параллельных методик - M6.
- Секции vs моноблок: M3/M6 окупаются при разных температурах/программах в одной смене; иначе достаточно M1.
- Каналы: закладывайте 5 каналов, если мультиплекс в ТЗ на 2-3 года; проверяйте спектр под ваши красители.
- Мультиплекс и NTC: пилот на целевых наборах + резерв лунок под NTC в каждом прогоне S1.
- Клиника vs НИИ: для клиники - РУ, клинические шаблоны DT-Master и обмен с ЛИС; для НИИ - гибкость melting/SNP и автономный режим.
- Интеграция: робот, автономный режим без ПК, открытые наборы - отметьте в ТЗ до тендера.
- Соседняя модель: при потоке до 48 позиций смотрите DT-Lite; DT-Prime - шаг к 96/384 и плотной смене.
Если вам нужен днк амплификатор для среднего и большого потока
Рассмотрите Real-time DT-Prime: блоки до 96 и 384 лунок, до пяти каналов детекции, ПО DT-Master, ЛИС и регистрационное удостоверение по описанию производителя.
В каталоге АССА есть линейка ДНК-Технология и соседние модели real-time - конфигурацию лучше собрать под перечень методик, а не «на вырост». Александра, технический специалист по подбору лабораторного оборудования, поможет сопоставить блок M1/M3/M6/X1, каналы и ПО с вашим потоком образцов.
- Тел.: 8 (499) 490-02-72
- Email: blog@assa-group.ru
Итог
Днк амплификатор DT-Prime закрывает лаборатории, где критичны 96- или 384-луночные прогоны, мультиплекс до пяти каналов и связка с ЛИС. Опирайтесь на дизайн прогона из MIQE: один прогон, IRC при разделении, NTC и валидация мультиплекса S1. Для компактного потока оставьте в поле зрения DT-Lite; для DT-Prime заранее выберите тип блока и клинический контур данных.
Источники:
- Bustin S.A. et al. MIQE précis: Practical implementation of minimum standard guidelines for fluorescence-based quantitative real-time PCR experiments. BMC Molecular Biology. 2010. DOI: 10.1186/1471-2199-11-74
Подписка на материалы блога
Оставьте email, чтобы получать новые статьи, новости и обновления товарного портфеля АССА.
Теги: днк амплификатор, амплификатор днк технологии, real-time dt-prime, пцр в реальном времени, dt-master