MiniSeq сочетает в себе лучшие черты секвенаторов MiSeq и NextSeq: использование одноразовых картриджей с реагентами, упрощённую систему флюидики и компактные размеры. MiSeq обеспечивает исключительную скорость работы, и, при своих компактных размерах, позволяет получить до 7,5 Gb данных и порядка 25 млн чтений всего за сутки.
Эти характеристики делают MiniSeq подходящим для решения следующих задач:
1) Онкология
- анализ соматических мутаций в солидных опухолях (панели TruSight Tumor 15 / Tumor 26, TruSeq Amplicon Cancer Panel) и миелоидных новообразованиях (TruSight Myeloid)
- анализ предрасположенности к онкологическим заболеваниям (TruSight Cancer)
- исследование ракового транскриптома (TruSight Pan-Cancer)
2) РНК-секвенирование
- 10 готовых панелей серии TruSeq Targeted RNA Expression для оценки экспрессии генов
- возможность создания кастомной панели для исследования генной экспрессии
- изучение малых РНК (TruSeq Small RNA)
3) Таргетное секвенирование
- собственная панель, либо на основе наработки ампликонов (TruSeq Custom Amplicon), либо на основе обогащения (Nextera Rapid Capture Custom Enrichment).
4) Предимплантационный генетический скрининг
- VeriSeq PGS (станет доступным для MiniSeq в ближайшем будущем)
5) Полногеномное секвенирование небольших геномов (до 5 Mb)
6) Исследование клинического экзома
- панель TruSight One
Характеристики MiniSeq
Общая производительность
|
Версия реагентов |
|
Mid Output |
|
High Output |
|
Количество чтений, млн |
|
8 |
25 |
|
|
Максимальная длина чтения |
|
2x150 |
2x150 |
|
|
Максимальная производительность, Gb |
|
2.5 |
7.5 |
Время работы (формирование кластеров + секвенирование)
|
Длина прочтения, Mid Output |
|
Время, ч |
|
2x150 |
|
17 |
|
|
|
Длина прочтения, High Output |
|
Время, ч |
|
2x150 |
|
24 |
|
2x75 |
|
13 |
|
1x75 |
|
7 |