Cистемы для таргетного секвенирования нового поколения на основе полупроводниковой технологии
Абсолютно новая система Ion S5 создана, чтобы максимально упростить рабочий процесс и сделать секвенирование нового поколения доступным для любой лаборатории!
В комплексе с системой автоматической пробоподготовки Ion Chef, Ion S5 позволяет максимально просто, быстро и воспроизводимо проводить исследования любых масштабов и сложности:
от небольших геномов и панелей генов, до транскриптома и полного экзома человека.
Благодаря трем чипам для секвенирования разной емкости вы всегда можете выбрать оптимальное решение для вашего эксперимента.
| Simplicity | Speed | Small sample input | Scalability | Simple analysis |
| Самый простой Самый простой путь от ДНК до данных. Минимум ручной работы – максимум достоверности и воспроизводимости |
Самый быстрый Самый короткий путь от ДНК до данных всего за 24 часа. Минимум времени на детекцию и обработку сигнала – сила природной биохимии |
Самый экономичный Самое минимальное количество образца для исследования. Минимум 1 нг ДНК или РНК для исследования мутаций или экспрессии |
Самый гибкий Самая масштабируемая система. Минимум усилий для выгодного исследования любого количества образцов – три варианта чипов |
Самый простой анализ Torrent Suite™ Software и Ion Reporter™ Softwareсделают процесс анализа данных легким и быстрым для вас |
Время секвенирования – 2.5 – 4 часа. Процедура пробоподготовки, секвенирования и анализа данных занимает 1 день. Производительность прибора – от 0,6 до 15 Гб за один запуск секвенатора; три чипа под разные задачи исследования.
Высокое качество сиквенса. Идеален для анализа SNP: самая низкая частота однонуклеотидных ошибок чтения (мистмэтч-ошибок) среди настольных секвенаторов нового поколения.
Простой рабочий процесс, возможность автоматизации пробоподготовки (в том числе подготовки библиотек) с системой Ion Chef™, легкое управление прибором. Все расходные материалы представлены в виде картриджей, запуск секвенатора занимает 15 минут.
Самая массовая и цитируемая настольная технология NGS-секвенирования. Всемирное сообщество исследователей «Ion Сommunity» насчитывает более 25 тысяч членов, продано уже более 2000 приборов по всему миру. Технология использована в более чем 950 научных работах, опубликованных в рецензируемых журналах за рубежом.
Приложения:
| Фундаментальная наука | Клинические исcледования |
| Полноэкзомное секвенирование | Клинический экзом |
| Сборка геномов de novo | Типирование микроорганизмов |
| Метагеномика 16S | Микробиом |
| Поиск онко-маркеров | Генетическая диагностика опухолей |
| Разработка новых решений для диагностики и персонализированной медицины | Предимплантационная и неинвазивная диагностика |
| Виды микрочипов | |
| Ion 510 | |
| Количество чтений за прогон (число ридов) | 2 - 3 млн |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 200 п.н.) | 0,3 - 0,5 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 400 п.н.) | 0,6 - 1 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 600 п.н.) | - |
| Длина прочтения, пар нуклеотидов | 200 / 400 |
| Время секвенирования при длине прочтения 200 п.н. | 2,5 ч |
| Время секвенирования при длине прочтения 400 п.н. | 4 ч |
| Время секвенирования при длине прочтения 600 п.н. | - |
| Ion 520 | |
| Количество чтений за прогон (число ридов) | 4 - 6 млн |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 200 п.н.) | 0,6 - 1 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 400 п.н.) | 1,2 - 2 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 600 п.н.) | 0,5 - 1,5 млрд. п.н. |
| Длина прочтения, пар нуклеотидов | 200 / 400 / 600 |
| Время секвенирования при длине прочтения 200 п.н. | 2,5 ч |
| Время секвенирования при длине прочтения 400 п.н. | 4 ч |
| Время секвенирования при длине прочтения 600 п.н. | 4 ч |
| Ion 530 | |
| Количество чтений за прогон (число ридов) | 15 - 18 млн |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 200 п.н.) | 3 - 3,5 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 400 п.н.) | 6 - 7,2 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 600 п.н.) | 1,5 - 4,5 млрд. п.н. |
| Длина прочтения, пар нуклеотидов | 200 / 400 / 600 |
| Время секвенирования при длине прочтения 200 п.н. | 2,5 ч |
| Время секвенирования при длине прочтения 400 п.н. | 4 ч |
| Время секвенирования при длине прочтения 600 п.н. | 4 ч |
| Ion 540 | |
| Количество чтений за прогон (число ридов) | 60 - 80 млн |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 200 п.н.) | 10 - 15 млрд. п.н. |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 400 п.н.) | - |
| Произволительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 600 п.н.) | - |
| Длина прочтения, пар нуклеотидов | 200 |
| Время секвенирования при длине прочтения 200 п.н. | 2,5 ч |
| Общие параметры | |
| Время секвенирования при длине прочтения 200 п.н. | 2,5 ч |
| Первичный анализ данных | Torrent Suite |
| Вторичный анализ данных, аннотация | Ion Reporter™ |
| Форматы выходных данных | FASTQ, BAM, SFF, VCF |
| Число образцов, одновременно секвенируемых за 1 запуск прибора | 1 - 384 |
| Размеры (Ш х Г х В) | 261 х 566 х 566 мм |
| Вес | 63,5 кг |
| Требуемая мощность сети | 100 - 240 В |
| Компьютерный сервер для обработки и хранения данных | только с моделью Ion S5™ XL |