Система Fluidigm BioMark™ HD имеет широкий спектр приложений – анализ РНК, микроРНК, ДНК и белков. В зависимости от задач система позволяет проводить от 144 до 37 тыс. уникальных ПЦР за запуск прибора в режиме реального времени. Система не привязана к конкретным производителям реагентов, а нанолитровые объемы реакций и мультиплексность до 4-х каналов флуоресценции существенно снижают стоимость исследований.
Система Fluidigm BioMark™ HD применяется для анализа экспрессии генов, в том числе единичных клеток, микроРНК, высокоскоростного SNP генотипирования, проведения цифровой ПЦР для определения копийности генов (CNV) и абсолютного количественного подсчета нуклеиновых кислот, целевой амплификации участков ДНК для последующего секвенирования, белкового профилирования и других задач, требующих высокой точности и воспроизводимости.
Особенности:
- Открытая платформа для реагентов. Можно использовать различные конфигурации ПЦР-систем и разные типы образцов.
- Готовые наборы для анализа экспрессии генов, SNP генотипирования и анализа копийности генов на основе технологии TaqMan.
- Возможность заказа кастомизированной панели с помощью сервиса Fluidigm D3™ Assay Design.
- Экономия времени и денег. За счет использования нанолитровых объемов технология жидкостных микрочипов Fluidigm позволяет значительно снизить затраты на реагенты, уменьшить сроки проведения эксперимента и нет необходимости в автоматизированных системах раскапывания.
- Масштабируемость эксперимента. Используя новые многоразовые чипы FlexSix и классические чипы формата 96.96 возможно проведение от 144 до 9216 ПЦР за один запуск прибора при анализе транскриптов или полиморфизмов ДНК.
- Ультравысокая производительность. Возможно проведение до 150 тысяч анализов в день.
- Классическая платформа для анализа транскриптома единичных клеток. Получение воспроизводимых данных как на целой клеточной популяции, так и на уровне единичной клетки. Уже более 100 публикаций с использованием этой платформы.
Система комплектуется IFC контроллером для заполнения чипов реагентами (в зависимости от задач и процессируемых микрочипов могут использоваться разные IFC контроллеры), сканером для флуоресцентной детекции сигнала с внутренним термоциклером, набором программного обеспечения.
Жидкостные чипы:
Чип FLEXsix™ для анализа экспрессии генов или генотипирования
Арт.:
Fluidigm FLEXsix™ Gene Expression
Fluidigm FLEXsix™ Genotyping
Каждый чип содержит 6 независимых сегментов, содержащих 12 лунок для ввода образцов и 12 лунок для реакционных смесей. Комбинирование используемых сегментов чипа позволяет использовать за запуск от 1 до 6 сегментов в различных вариантах. Последовательное использование всех сегментов чипа возможно за несколько запусков в течение нескольких месяцев.
- Объем лунки для введения образца: 3 мкл.
- Объем реакционной камеры: 9 нл.
- Используемый тип IFC контроллера: HX, Juno
Чип 48.48 Dynamic Array для анализа экспрессии генов или генотипирования
Арт.:
Fluidigm BMK-M-48.48
Fluidigm BMK-M-48.48GT
- Кол-во тестируемых образцов: 48
- Кол-во тестируемых маркёров: 48
- Количество ПЦР за запуск: 2304
- Объем лунки для введения образца: 5 мкл
- Объем реакционной камеры: 10 нл
- Используемый тип IFC контроллера: MX, Juno
Чип 96.96 Dynamic Array для анализа экспрессии генов или генотипирования
Арт.:
Fluidigm BMK-M-96.96
Fluidigm BMK-M-96.96GT
- Кол-во тестируемых образцов: 96
- Кол-во тестируемых маркёров: 96
- Количество ПЦР реакций за запуск: 9216
- Объем лунки для введения образца: 5 мкл
- Объем реакционной камеры: 6,75 нл
- Используемый тип IFC контроллера: HX, Juno
Чип 192.24 Dynamic Array для анализа экспрессии генов или генотипирования
Арт.:
Fluidigm BMK-M-192.24
Fluidigm BMK-M-192.24GT
- Кол-во тестируемых образцов: 192
- Кол-во тестируемых маркёров: 24
- Количество ПЦР за запуск: 4608
- Объем лунки для введения образца: 3 мкл
- Объем реакционной камеры: 9 нл
- Используемый тип IFC контроллера: RX, Juno
Чип qdPCR 37K для проведения цифровой ПЦР
Арт.:
Fluidigm 100-6151
- Кол-во тестируемых образцов: от 1 до 48
- Количество ПЦР реакций за запуск: 36960
- Объем лунки для введения образца: 8 мкл
- Объем реакционной камеры: 0,85 нл
- Используемый тип IFC контроллера: MX, Juno
Характеристики
| Чувствительность | детекция вплоть до 1 молекулы |
| Производительность, реакций за запуск | от 144 до 864 реакций за запуск с чипом FLEXsix™, 2304 за запуск с микрочипом 48.48 Dynamic Array IFC, 4608 за запуск с 192.24 Dynamic Array IFC, 9216 за запуск с микрочипом 96.96 Dynamic Array IFC, 36960 за запуск с микрочипом qdPCR 37K IFC |
| Фильтры возбуждения сигнала, нм | 475±41, 530±16, 575±31 + дополнительно 632±27 |
| Фильтры детекции сигнала, нм | 525±25, 570±30, 630±30 + дополнительно 700±30 |
| Детекция | CCD камера 9 Mpixel, 12мкм, размер пикселя 12 мкм |
| Источник света | LED |
| Температурный контроль | Пельтье элементы, от 4°С до 99°С , макс. скорость нагрева-охлаждения >5°С/с |
| Используемые чипы | Dynamic Array IFCs (48.48, 96.96, 192.24 чипы), Digital Array IFC - qdPCR 37K IFC, FLEXsix™ IFC |
| Программное обеспечение | Fluidigm Data Collection Software, Fluidigm Real-Time PCR Analysis Software, Fluidigm SNP Genotyping Analysis Software, Fluidigm Digital PCR Analysis Software |
| Компьютер и аксессуары | Windows XP PRO, не менее 2 Гб оперативной памяти, 300 Гб пространства на жёстком диске, 4 USB порта, LCD монитор с плоским экраном, клавиатура и мышь |
| Хранение данных | 1 Гб/с Ethernet соединение; 40 GB пространства на жестком диске; USB порт для переноса данных |